Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm3239L7N2D9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3239L7N2D9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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