Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2056J3QQ02 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms