Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20877J3QPZ4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms