Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC024978J3QPC3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms