Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms