Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11236J3QMS7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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