Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms