Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SprtnG3X912 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms