Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LctF8VPT3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms