Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Igkv1-99F6XWB2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms