Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SmgcF6VRN1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SmgcF6VRN1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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