Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm17555F6U8B9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm17555F6U8B9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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