Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf4E9QAP7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms