Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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