Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC005561E9Q5E2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC005561E9Q5E2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC005561E9Q5E2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC005561E9Q5E2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms