Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fndc1E9Q043 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms