Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms