Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph10bE9PYQ0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms