Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde2E9PUP1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms