Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms