Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rnf217D3YYI7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf217D3YYI7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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