Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms