Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17333C6EQI3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms