Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce3B5KM66 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms