Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf11bB4XVQ1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf11bB4XVQ1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms