Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms