Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5483B2RV77 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms