Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Abcc8B2RUS7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms