Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PtprbB2RU80 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PtprbB2RU80 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PtprbB2RU80 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PtprbB2RU80 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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