Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Prrt4B2RU40 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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