Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms