Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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