Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf518bB2RRE4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf518bB2RRE4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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