Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms