Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brpf3B2KF05 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms