Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H60cB1B213 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms