Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfx1B1AY10 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms