Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Skint7A7XV04 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Skint7A7XV04 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Skint7A7XV04 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Skint7A7XV04 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Skint7A7XV04 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Skint7A7XV04 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Skint7A7XV04 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skint7A7XV04 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms