Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm6880A3KG45 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm6880A3KG45 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm6880A3KG45 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm6880A3KG45 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm6880A3KG45 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm6880A3KG45 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm6880A3KG45 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm6880A3KG45 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm6880A3KG45 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm6880A3KG45 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6880A3KG45 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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