Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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