Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn3aA2ASI5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms