Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rtf1A2AQ19 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rtf1A2AQ19 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rtf1A2AQ19 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rtf1A2AQ19 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rtf1A2AQ19 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms