Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtcflA2APF3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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