Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fam43bA2AM80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms