Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ambra1A2AH22 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms