Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprfA2A8L5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms