Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RNP2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms