Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3238W4VSP7 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms