Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Speer3W4VSP1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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