Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm28036V9GXJ1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm28036V9GXJ1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28036V9GXJ1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28036V9GXJ1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm28036V9GXJ1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm28036V9GXJ1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28036V9GXJ1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28036V9GXJ1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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